Kertenkeleler, ekosistemlerde önemli bir rol oynar, özellikle böcek popülasyonlarını kontrol etme görevleriyle dikkat çekerler. Karıncalar, böcekler ve örümcekler gibi çeşitli böceklerle beslenerek ekolojik dengeyi korurlar. Bu avlanma, böceklerin aşırı çoğalmasını önler, aksi takdirde zararlı hale gelebilir ve tarıma zarar verebilirler.

Ayrıca, kertenkeleler besin zincirinin önemli bir parçasıdır ve kuşlar ve yılanlar gibi birçok yırtıcı için av görevi görürler. Bu, ekosistem boyunca enerjinin aktarılmasında önemli bir bağlantı sağlar. Varlıkları, bu yırtıcıların hayatta kalmasını destekler ve yaşam alanlarının genel sağlığına ve istikrarına katkıda bulunur.

Zararlı kontrolü ve besin zincirindeki rollerinin yanı sıra, kertenkeleler bitki yayılımına da katkıda bulunur. Bazı kertenkeleler, tohumların yayılmasına yardımcı olur, bu da bitki üremesi ve biyolojik çeşitliliğin korunması için önemlidir. Tohumları yeni yerlere taşıyarak, çeşitli bitki türlerinin büyümesini sağlarlar ve çeşitli ve dirençli bir ekosistemi desteklerler.